��þѹ�ء�����ǹ�˭��� DNA ��¤�� ������ʺҧ��Դ��ҹ�鹷������þѹ�ء����� DNA �������Ǻ�ҧ �� RNA ��ҧ 㹷������Ҩоٴ�֧�ç���ҧ�ͧ��� DNA ��� RNA ����˹�ҷ�����չ ��Шоٴ�֧�ʢͧ DNA (A, G, C, T) ��Тͧ RNA (A, G, C, U) ��С�èѺ��������ҧ����� �������ѹ��ѧ (backbone) �»�Сͺ���¹�ӵ����п�� ��觿������ջ�Ш���ź��� pH ���Ԣͧ��ҧ���
������§��Ǣͧ��� DNA ��� RNA ������¹�� �Ѻ�ҡ��ҧ 5' ���� 3' ��С���ҧ����·���仨��ҧ�����������������ǵ�������ҵ� �ҡ�ա�èѺ������ѹ��ѧ㹺���dz����� �ѡ�ա�����¹�������ǹ�˭� ���Ҩ���¹���º�ҧ����
�ٻ��ҧ�ͧ DNA 2 �����������Ẻ ��Դ������ѡ�ѹ�դ�� Ẻ A, B ��� Z ��駹�� DNA �Ҩ���յ���� 1 ��� 2 ��� �����ҡ���ҹ�鹡���
DNA �·�������ѡɳ��ç���ҧ������Ǥ�� ��Сͺ���¹�ӵ�Ŵ��͡������ ������ ����� �Ѻ�ѹ���¾ѹ������Ź�� ������¡��ҹ�Ǥ����䷴� (nucleotide) (�Ҿ��� 2.1) ��Ǥ����䷴��������š�����§��͡ѹ���¾ѹ�п����������� (phosphodiester bond) �Դ����չ�Ǥ����䷴� (polynucleotide) ��չ�Ǥ����䷴�������¨����§��Ǩҡ 5'-3' �ǹ��ȡѹ ���ִ���˹觢ͧ��ӵ������ѡ (�Ҿ��� 2.2) ����ӵ�Ŵ��͡������������������ç��ѡ�ͧ������� ������� 4 ��Դ (�Ҿ��� 2.3) ����������ҧ��� �ʴѧ����������дչչ (Adenine; A) ��ҹչ (Guanine; G) �չ (Cytosine; C) �����չ (Thymine; T) ��èѺ�ѹ�ͧ����������ҧ��� DNA ����¾ѹ������ਹ ���� A �Ѻ�Ѻ T ��� C �Ѻ�Ѻ G �ʷ��Ѻ���ѹ����ҹ�����¡��� �ʤ���� (complementary base) (�Ҿ��� 2.4)
�Ҿ��� 2.1 �ç���ҧ�ͧ��Ǥ����䷴��觻�Сͺ���¹�ӵ�Ŵ��͡������ �����������
��ҹ�Դ��Ҿѹ������ਹ������������������ҧ DNA 2 �����Ҵ��¡ѹ ��§�����������з���� DNA ������Ǥ�������� �����վѹ������ա������������Ǣ�ͧ
�Ҿ��� 2.2 �ç���ҧ�ͧ DNA ����Ǥ��
�Ҿ��� 2.3 ��� 4 ��Դ�����ͧ���Сͺ�ͧ��Ǥ�������
�Ҿ��� 2.4 ��èѺ�ѹ�ͧ�������ҧ��� DNA
�ç���ҧ DNA Ẻ����Ǥ�����¹��� (right-handed double helix DNA) ����ʹ����ѵ�ѹ��Ф�� ��Сͺ������չ�Ǥ����䷴� 2 ������¹�����价ҧ����ǹ��ȡѹ �������������ʨѺ�ѹ 10 ����йҺ ���Ф���������繢�鹺ѹ���ҧ�ѹ 0.34 ������� ��з���� 36 ͧ�ҡѺ�ʤ��Ѵ� ��þѹ����Ƿ�����Դ��ͧ 2 ��Ҵ �����ͧ��Ҵ�˭� (major groove) �����ͧ��Ҵ��� (minor groove) �繵��˹���Тͧ������š�����ª�Դ DNA �ѡɳй��Ѵ��Ẻ B (�Ҿ��� 2.5) �ç���ҧ����Ǥ��ͧ DNA ����ö�Դ��֧ 6 Ẻ ���Ẻ A, B, C, D, E �������������¹������ Ẻ Z �������������¹���� DNA ��辺�������ժ��Ե�� 3 Ẻ���Ẻ A-DNA, B-DNA ��� Z-DNA (�Ҿ��� 2.6) ���辺����¤��Ẻ B
�Ҿ��� 2.5 �ç���ҧ B-DNA ����ʹ����ѵ�ѹ��Ф�� (����) ��ͧ��� 2 ��Ҵ�ͧ DNA (���)
�Ҿ��� 2.6 DNA Ẻ A ,B ��� Z
�ç���ҧ�ͧ DNA �͡�ҡ��������Ǥ������ �Ҩ���ç���ҧ���������� ���������������ա���� ���ͧ�ҡ��èѺ�ѹ�ͧ��������� DNA ����ö�Ѻ�ѹ���ҡ���� 2 �� ����� DNA 1 ��� �Ѻ�Ѻ DNA ����Ǥ������ DNA 3 ��� (�Ҿ��� 2.7) ��èѺ�ѹẺ�������ö�Ѻ��駡���ʴ��͡�ͧ�չ�� (�С���Ƕ֧㹺���� 3)
�Ҿ��� 2.7 �ç���ҧ DNA 3 ��� (����) ��èѺ�ѹ�ͧ�� 3 ��� ������� (��ҧ, ���)
����Ѻ DNA 4 ��� �о���٤����͵����dz��ǹ���¢ͧ��������������¡��� '��������� (telomere)' �繵��˹觷���ա�ë������ʷ��Ҵ���仨ҡ����ѧ������ DNA ��� lagging ����������������� (telomerase enzyme) ����� RNA �繵�Ẻ �ç�����������о��ʡ�ǹչ (G) ���§���� �ѹ ��� DNA 4 ��¨�����ѹ���ա�èѺ�ѹ�����ҧ�ʡ�ǹչ 4 ��� ���������йҺ���ǡѹ (�Ҿ 2.8)
�Ҿ��� 2.8 �ç���ҧ DNA 4 ��� (����) ��èѺ�ѹ�ͧ�� 4 ��� ������� (���)
�����֧���ç���ҧ�ͧ DNA �������ٻẺ �� ����Ǥ�� �������� �������� ��������¹��� ��������¹���� ��й͡�˹�ͨҡ���¡������ҧ�ҹ�� �� DNA �ѡɳ���ա��ҧ
㹻Ѩ�غѹ�ա����������дѺ���㹡���ѧ������ DNA �¹� DNA ������·���ջ����˹��� (sticky end) ������ʷ����Ҥ��ѹ�����������͡ѹ �¡���������͡ѹ�������ö�Դ������Ẻ ���·�ȷҧ �������Ѻ�ӴѺ�ʢͧ DNA ������·���ҵ�͡ѹ ������� DNA ������ٻ�ç��ҧ � �� �ٻ�Ң��� 2 �Ե� (2-D lattice) �ٻ�١��ȡ� (a cube) �ٻ�ç�������Ỵ˹�� (a truncated octahedral) �繵�
�Ҿ�ʴ�����������͡ѹ�ͧ DNA ����ջ����˹��� (sticky end)
�Ҿ�����ʴ������� DNA 4 ��·���ա�èѺ����ʨ��Դ���ç���ҧ������ѡɳ����� 4 �¡ (branched junctions) ���ͧ�ҡ�ջ����˹��� (sticky end) ������ʷ������ö�Ѻ���ѹ�� �ѧ�����������������͡ѹ�ͧ �������ٻ�Ң��� 2 �Ե� (2-D lattice) �ѧ�Ҿ���
DNA ������ç���ҧ���ٻ�١��ȡ�
������ç���ҧ���ٻ�ç�������Ỵ˹��
������ç���ҧ���ٻ�ç�������Ỵ˹��
.�բ�� .
= ���յ�ҧ�= ��ӵ�ſ�� ������ѹ��ѧ �ͧ�������������͡�ҡ��� �ѧ�ա�ù� DNA ������ٻ��ҧᵡ��ҧ� �� B-DNA (��������¹���), Z-DNA (��������¹����), B-DNA 3-arm branched junction (��������¹����� 3 �¡), Z-DNA 3-arm branched junction (��������¹������ 3 �¡) �һ�Сͺ����ѹ ������� DNA ������ٻ��ҧᵡ��ҧ�ѹ����Ẻ �ѧ�ٻ��ҧ��ҧ���
..���йӡԨ��������������������������¹��� ����ǡѺ�ç���ҧ����ԵԢͧ DNA ����Ǥ�����ҧ���ԵԷ��١��ͧ �¡���Ѵ���ҧẺ���ͧ����Ǥ����µ��ͧ �����ѵ�ػ��ʧ������
- ��������� �Ҩ������йѡ���¹ �ѡ�֡�� ����ö���ç���ҧ�ͧ���������Ǥ��Ẻ�����ҧ�١��ͧ��ԵԷ���Ӥѭ �����㹡�����¹������㹷ء�ç���¹ ���ʶҺѹ �繡���������������¹�����µ��ͧ
- ������������¹��㹽֡���ҧẺ���ͧ���������Ǥ����µ��ͧ �����������ҧ����������������Ԫ������ҧ���ԧ
..�繪شẺ���ͧ DNA ����Ǥ�� ������ԵԶ١��ͧ �ӧ��� �ҤҶ١ ��Сͺ����ͧ���Сͺ��ҧ � ���Өҡ�蹾��ʵԡ����դ���� �������ҧẺ���ͧ DNA ����Ǥ�����¹������ҧ�١��ͧ��ԵԷ���Ӥѭ������ ����������͡�����ҧẺ���ͧ������繢�鹵���ҧ�Ѵਹ ������Сͺ����ö�Դ������§���
. �ŷ��������ͻ�Сͺ���� ���� DNA ����Ǥ��Ẻ�շӴ����蹾��ʵԡ�� ����դ���ʷ�����ԵԵ�ҧ� ���١��ͧ ���ѹ��ѧ������Ƿ�����ԵԶ١��ͧ�١��ͧ��� 2 ��� ����ǹ�ҧ�ѹ �������ͧ�˭������ͧ��硢ͧ�ѹ��ѧ��Ѵ��ǹ���١��ͧ���� ��觷���Ӥѭ�������ö�ͧ��繡�����§��Ǣͧ�� ��С�èѺ����������ҧ�Ѵਹ�ҡ��� 2 ���� ��С�úԴ�ͧ����ʫ������Դ�ѹ���������ԡ����ҧ�Ѵਹ
...��駹��������Ժ�¡�÷�˹�ҷ���ҧ�ͧ DNA �����駡�èѺ�Ѻ�õչ�Ǻ�����������ҧ������ҧ�����´�����
�ѡɳо���ɷ���ҧ�ҡẺ���ͧ DNA �����
- ����ʷ���駫��ѹ�ء������§�����ЪѴਹ
- �����������ҧ������� ����ҧẺ���ͧ��Ѻ��ȷҧ����ҧ�����������������¹�ٻ��ҧ� ���Ẻ���ͧ����价������
����Ѻ RNA �����ç���ҧ����� DNA ��ͻ�Сͺ���¹�Ǥ����䷴ ������§�������͡ѹ���¾ѹ�п�����������������չ�Ǥ����䷴� ��ͧ���Сͺ�ͧ��Ǥ����䷴�ᵡ��ҧ�ѹ����ӵ�� ��� �� �¹�ӵ��� RNA ������ ��ǹ��� RNA �����ҫ�� (U) ��᷹��չ (T) (�Ҿ��� 2.9) �͡�ҡ��� RNA ��ǹ�˭��ѧ����չ�Ǥ����䷴��������� (�Ҿ��� 2.10) ��觵�ҧ�ҡ DNA �����ǹ�˭�������Ǥ��
�Ҿ��� 2.9 �ʷ�辺� RNA ����ͧ���Сͺ����¢ͧ DNA ���ҧ�ѹ�ç�����ҫ����᷹��չ
�·����� RNA ���������ҫ��᷹��չ ��㹺ҧ�óըо���չ� RNA ��ҧ�������
�Ҿ��� 2.10 �ç���ҧ RNA �������չ�Ǥ����䷴���������
...RNA ���� 3 ��������� ���������������� (messenger RNA ; mRNA) ��ҹ������������ (transfer RNA ; tRNA) ��� �������������� (ribosomal RNA ; rRNA) RNA ��� 3 ����������������·���仨�����չ�Ǥ����䷴��������� ����պҧ��ǹ�ͧ��·���ʫ���繤�����ѹǡ����ҨѺ�ѹ �������� RNA ���л��������ٻ��ҧ��ҧ� �������Ѻ��èѺ�ѹ�ͧ�ʤ�������� RNA ���
....mRNA (�Ҿ��� 2.11) �� RNA ��ѡ�����������Ǣ�ͧ�Ѻ������ҧ�õչ�·ӧҹ�����Ѻ tRNA ��� rRNA
.... tRNA (�Ҿ��� 2.12) �� RNA �����¹ӡô���������ҧ����õչ����Դ��鹺� mRNA ��������
.... rRNA (�Ҿ��� 2.13) �� RNA ������������� ����㹡���ִ�Ѻ tRNA ��� mRNA
�Ҿ��� 2.13 rRNA
㹻Ѩ�غѹ�ա���֡�Ҿ���� �͡�ҡ��������ͷ�� 3 ������������������� (mRNA� tRNA ��� rRNA) �ѧ����������ͻ���������ա ��� siRNA, shRNA ��� miRNA
............siRNA (short interfering RNA) �� RNA ����Ǥ��������� ����� 21-23 ��Ǥ����䷴� ��еç����dz���� 3� �ͧ������¨���������͡�� 2 ��Ǡ(3' overhang) (�Ҿ��� 2.14 ����) RNA ��Դ��龺��٤����͵ �¤鹾������á�˹��ǡ��� Caenorhabditis elegans ��պ��ҷ㹡���Ѻ��駡���ʴ��͡�ͧ�չ ��觨С���ǵ���㹺���� 3
............shRNA (short hairpin RNA) ���ç���ҧ�� stem-loop �� 25-29 ��Ǥ����䷴� �ç���� 3� ���������ҫ�� 2 �������͡�� (3� overhang) (�Ҿ��� 2.14 ���) ��Ǥ����䷴�������ç loop ��� �ж١�Ѵ�͡�����ѧ ���������ͻ���ҳ 21 ��Ǥ����䷴� ������ç���ҧ�����Ѻ siRNA �ѧ��� �ѹ�֧�դ�������ö㹡���Ѻ��駡���ʴ��͡�ͧ�չ�������ǡѺ siRNA
.............miRNA (micro RNA) �� RNA ��������������� ����� 19 - 23 ��Ǥ����䷴� �պ��ҷ㹡�äǺ�������ʴ��͡�ͧ�չ�����ǡѺ siRNA ��� shRNA
�Ҿ��� 2.14 ������ҧ�ç���ҧ�ͧ siRNA (����) ��� shRNA (���)
RNA �ҧ��Դ ����ö��˹�ҷ���������� �������� (ribozyme) ��� ��⺹�Ǥ����� �� (RNase P)
������ (ribozyme) ��������ͷ���˹�ҷ��Ѵ intron ���� mRNA ��������� exon ��Ҵ��¡ѹ ��㹹������� ��ⷤ���� ��Ф���þ��ʵ�ͧ����ժ��Ե�Ӿǡ�٤����͵ (eukaryote) ¡����ѵ���ա�д١�ѹ��ѧ (vertebrate) ���Ấ�����ºҧ��Դ
������١�鹾������á�����ժ��Ե�������� �Ӿǡ���Ƿ���ի����� (ciliated protozoa) ����ժ������ Tetrahymena thermophila �¹ѡ��ժ������ԡѹ���� ���� �� (Thomas �Cech)
���������礤鹾���� �� primary transcription �ͧ rRNA ��觨��ա�õѴ intron ��Ҵ 419 ��Ǥ����䷴��͡�ҡ���š�Ţͧ����ѹ�ͧ ���ͷ�����¡��� self-splicing group 1 intron ��ͨҡ����ѹ������� exon ����������Ҵ��¡ѹ ������� rRNA ���ӧҹ��
�Ҿ��� 2.15 �ç���ҧ�ͧ�������辺� Tetrahymena thermophila
㹻Ѩ�غѹ�ա�ä鹾��������������Դ��ԡ����� self-splicing �ͧ rRNA �����ǡѹ������ª�Դ �� hammerhead ribozyme, hairpin ribozyme, hepatitis delta virus ribozyme ��� Varkud satellite ribozyme
���..........��⺹�Ǥ����� �� (RNaseP, ribonuclease P) ��˹�ҷ��Ѵ�Թ�� (intron) �͡�ҡ���š�Ţͧ���-��ҹ�������������� (pre-tRNA)����繷�ҹ�������������� (tRNA)�������ö�ӧҹ�� RNA ��Դ���١�鹾��Ấ������ �¹ѡ����Է���дѺ���š�� ���᤹Ҵ� ���ͫԴ��� ��ŷ���� (Sidney Altman)